ウナギ養殖の課題とは？資源・技術・経営の3つの壁を徹底解説

最終更新: 2026-05-10

2025年漁期のシラスウナギ池入れ量は3月末時点で16.7トンと前年同期比20.3%増を記録し、鹿児島県では35年ぶりに採捕量が2,000kgを超えました（水産庁「ウナギに関する情報」2025年時点）。一方で、この「豊漁」でさえ1960年代のピーク時と比べれば10分の1以下の水準です。「ウナギ養殖にはどんな課題があるのか」「完全養殖は本当に実用化されるのか」といった疑問を持つ方は多いのではないでしょうか。この記事では、ウナギ養殖が抱える課題を「資源」「技術」「経営」の3つの軸で整理し、最新の研究動向から将来の展望までをわかりやすく解説します。まず資源問題の現状を確認し、次に完全養殖の技術的ハードル、そして養殖経営のコスト構造と人材の問題を順番に見ていきましょう。

ウナギ養殖の現状と全体像

日本で流通するウナギの99%以上は養殖ものです。しかし現在のウナギ養殖は、天然のシラスウナギ（稚魚）を河口や沿岸で採捕し、養殖池で成魚まで育てる「畜養型」が主流です。つまり養殖とはいえ、天然資源に完全に依存しているのが実情です。

ウナギ養殖が抱える課題は大きく分けて3つあります。天然稚魚の減少という「資源の壁」、完全養殖の実用化に向けた「技術の壁」、そして養殖経営を圧迫する「経営の壁」です。それぞれを詳しく見ていきます。

課題1：資源の壁 ── シラスウナギの減少と規制強化

ウナギ養殖の課題として最も根本的なのが、原料であるシラスウナギの激減です。

シラスウナギ漁獲量の推移

1960年代のピーク時には国内で年間200トン以上のシラスウナギが採捕されていました。しかし2024年漁期（2023年11月～2024年5月末）の国内養殖場への池入れ実績は15.8トンにとどまり、うち国内採捕分はわずか約5トンと「近年にない不漁」と評されました（みなと新聞 2024年報道）。

2025年漁期は鹿児島県で2,492.3kgと35年ぶりに2,000kgを超え、静岡県でも18年ぶりに2,000kgを上回るなど回復の兆しが見られます。しかしこれはあくまで短期的な変動であり、長期トレンドとしてはピーク時の10分の1以下の水準が続いています。

国際的な資源管理の強化

ニホンウナギは2014年にIUCN（国際自然保護連合）のレッドリストで絶滅危惧IB類（EN）に指定されました。これを受けて日本では養殖池への池入れ量に上限を設けるなどの国際的な資源管理に取り組んでいます。

具体的には、日本・中国・韓国・台湾の東アジア4か国・地域でシラスウナギの池入れ量を制限する枠組みが運用されており、日本の池入れ上限は年間約21.7トンとされています。こうした規制は資源保護に必要な措置ですが、養殖業者にとっては生産拡大の制約要因にもなっています。

課題2：技術の壁 ── 完全養殖の実用化はどこまで進んだか

天然シラスウナギへの依存から脱却するための切り札と期待されているのが、完全養殖の技術です。完全養殖とは、人工的にウナギを産卵させ、ふ化した仔魚をシラスウナギまで育て、さらに成魚にして再び産卵させるという、天然資源に頼らないサイクルを確立する技術を指します。

完全養殖の研究史

2010年、水産研究・教育機構（当時の水産総合研究センター）が世界で初めてニホンウナギの完全養殖に成功しました。人工ふ化から成長させたウナギを再び産卵させ、次世代の仔魚を得ることに成功したのです。

しかし実用化にはまだ大きな壁が残っています。完全養殖の研究課題を整理すると、以下の5つに分類されます。

最新の技術的ブレークスルー

2025年7月、水産研究・教育機構とヤンマーは共同で新たな量産用水槽を開発し、1水槽あたり約1,000尾のシラスウナギ生産に成功しました。これにより種苗1尾あたりの飼育コストは従来の約20分の1となる1,800円程度まで削減されています（水産研究・教育機構 プレスリリース 2025年7月）。

また水産庁は2025年度補正予算でウナギの人工種苗研究に7億円を計上し、年間4万～5万匹のシラスウナギ量産体制の構築を目指しています。2026年夏には人工ふ化ウナギを使ったかば焼きの試験販売も予定されており、商業化に向けた動きが加速しています（日本経済新聞 2026年1月報道）。

ただし現時点の人工種苗コストは1尾あたり約3,000円（水産庁試算）で、天然シラスウナギの平均単価と比較するとまだ割高です。大量生産によるコスト削減と、生存率の向上が今後の最大の技術課題といえます。

課題3：経営の壁 ── コスト構造と収益性の問題

ウナギ養殖の課題は資源や技術だけではありません。養殖経営そのものにも構造的な問題があります。

養殖コストの内訳

ウナギ養殖の経営を圧迫する主なコスト要因は以下の通りです。

特にシラスウナギの仕入れ価格は年によって大きく変動します。豊漁の年と不漁の年で価格差が数倍に開くこともあり、養殖業者の経営計画を立てにくくしています。ブリ養殖の費用構造と比較しても、原料調達リスクの高さはウナギ養殖の際立った特徴です。

生存率と歩留まりの問題

養殖ウナギの生存率は約70%といわれています。池入れしたシラスウナギの約3割が出荷前に死亡する計算です。死亡の主な原因は、水質悪化、病気（特にエドワジエラ症やパラコロ病）、共食い、ストレスなどです。

生存率を高めるためには水質管理の徹底と適切な飼育密度の維持が欠かせませんが、これは人件費やエネルギーコストの増加に直結します。コスト削減と品質維持のバランスが、養殖現場の日々の課題です。

ウナギ養殖業界で働くという選択肢 ── キャリアの観点から

ここまでウナギ養殖の課題を見てきましたが、裏を返せば課題が多い業界ほど変革の担い手が求められています。これは競合記事ではあまり触れられていない視点ですが、水産キャリアを考えるうえで重要なポイントです。

養殖業界では現在、以下のような人材ニーズが高まっています。

実際に養殖現場を取材すると、「技術革新によって養殖のやり方が大きく変わりつつある」という声を多く聞きます。従来の経験と勘に頼った養殖から、データに基づくスマート養殖への転換期にあり、IT系のスキルを持った人材が養殖業界に飛び込むケースも増えています。

養殖業への参入に興味がある方は、養殖業の始め方の記事で必要な資格や初期費用を詳しく解説していますので、あわせてご覧ください。

ウナギ養殖の課題を解決する最新技術と取り組み

課題が山積するウナギ養殖ですが、解決に向けたさまざまな取り組みが進んでいます。

陸上養殖（RAS）の導入

閉鎖循環式陸上養殖（RAS: Recirculating Aquaculture System）は、水を浄化・循環させながら陸上の施設で魚を育てる方式です。海面養殖と異なり、水温や水質を精密にコントロールできるため、ウナギ養殖との相性が良いとされています。

RAS方式のメリットは、排水による環境負荷の低減、病気の発生リスク低下、そして立地の自由度が高いことです。一方、初期投資が高額になる点と、電力コストが課題として残ります。

スマート養殖の実用化

AIが水質データやウナギの行動パターンを解析し、最適な給餌量とタイミングを自動で判断する「スマート給餌機」の導入が進んでいます。無駄な餌を減らすことで餌代を削減しつつ、残餌による水質悪化も防げるため、生存率の向上にもつながります。

また水温・溶存酸素・アンモニア濃度などをリアルタイムで監視するIoTセンサーの導入により、従来は熟練の養殖者の感覚に頼っていた水質管理が数値化・自動化されつつあります。

代替餌料の研究

ウナギの仔魚（レプトセファルス）の餌としては、従来サメの卵が使われてきましたが、入手が難しくコストも高いという問題がありました。現在は昆虫由来のタンパク質や微細藻類を活用した代替餌料の研究が各機関で進んでおり、餌料コストの大幅な削減が期待されています。

他の養殖魚種でも同様の取り組みが進んでおり、例えばサーモン養殖では昆虫飼料の実用化が先行しています。ウナギ養殖にもこうした技術の応用が期待されます。

ウナギ養殖の課題に関するよくある質問

Q1: ウナギの完全養殖はいつ実用化されますか？

完全養殖の技術自体は2010年に世界初の成功を収めていますが、商業ベースでの実用化にはまだ時間がかかる見通しです。2026年夏に人工ふ化ウナギのかば焼き試験販売が予定されており、水産庁は年間4万～5万匹の量産体制構築を目指しています。ただし、天然シラスウナギの需要を完全に代替するには年間1億尾以上の生産が必要とされ、コスト面での課題解決が不可欠です。

Q2: ウナギ養殖を個人で始めることはできますか？

法的には可能ですが、シラスウナギの採捕には都道府県知事の許可が必要であり、養殖池への池入れ量にも上限が設けられています。また初期投資（養殖施設の建設・シラスウナギの仕入れ）に数千万円規模の資金が必要です。新規参入を検討する場合は、既存の養殖業者のもとで研修を受けるルートが一般的です。

Q3: 養殖ウナギと天然ウナギはどう違うのですか？

養殖ウナギは安定した環境で育てられるため脂のりが良く、身が柔らかいのが特徴です。天然ウナギは季節や生息環境によって味わいが変わり、引き締まった身質と独特の香りが評価されます。栄養面では大きな差はありませんが、養殖ウナギのほうが脂質含量がやや高い傾向があります。詳しくは[養殖魚と天然魚の違い](https://suisan-navi.jp/aquaculture/farmed-vs-wild-fish/)の記事で解説しています。

Q4: ニホンウナギは絶滅の危機にあるのですか？

2014年にIUCN（国際自然保護連合）のレッドリストで絶滅危惧IB類（EN）に指定されています。ただし「食べてはいけない」ということではなく、資源管理を徹底しながら持続可能な利用を図ることが求められています。日本では池入れ量の制限や河川環境の整備など、資源回復に向けた取り組みが進んでいます。

Q5: ウナギ養殖の主な産地はどこですか？

日本国内では鹿児島県が最大の産地で、全国生産量の約40%を占めています。次いで愛知県（一色町が有名）、宮崎県、静岡県（浜名湖周辺）が主要産地です。温暖な気候が養殖に適しており、加温のためのエネルギーコストを抑えられるため、九州地方に産地が集中しています。

Q6: ウナギ養殖の環境への影響はありますか？

従来型の開放式養殖では、排水に含まれる窒素やリンが周辺水域の富栄養化を引き起こす可能性があります。また薬剤の使用による環境汚染のリスクも指摘されています。近年は閉鎖循環式陸上養殖（RAS）の導入や、無投薬養殖の取り組みにより、環境負荷の低減が図られています。

まとめ：ウナギ養殖の課題を理解し、将来を見据える

ウナギ養殖の課題は以下の3点に集約されます。

• 資源の壁: シラスウナギの長期的な減少傾向と国際的な規制強化。2025年漁期は豊漁だが、構造的な問題は解消されていない
• 技術の壁: 完全養殖は成功しているが、商業ベースでの量産にはコスト削減と生存率の向上が必要。2026年夏の試験販売が1つの転機になる
• 経営の壁: シラスウナギ価格の変動、餌代・エネルギーコストの上昇、人手不足が養殖経営を圧迫している

一方で、スマート養殖やRAS、代替餌料の研究など、課題を解決するための技術革新も急速に進んでいます。水産庁の予算措置（2025年度補正予算7億円）も後押しとなり、ウナギ養殖は大きな変革期を迎えています。

ウナギ養殖に限らず、養殖業界全体の最新動向を知りたい方は、まず養殖業の始め方ガイドから全体像を把握してみてください。水産業界でのキャリアに関心がある方には、業界で必要な水産・漁業の資格一覧もおすすめです。

参考情報

• 水産庁「ウナギに関する情報」（https://www.jfa.maff.go.jp/j/saibai/unagi.html）
• 水産研究・教育機構「ウナギ人工種苗生産技術に関する情報」（https://www.fra.go.jp/home/kenkyushokai/unagi/unag_info.html）
• 水産研究・教育機構「シラスウナギの生産コストの大幅な削減に貢献する新たなウナギ種苗量産用水槽を開発」プレスリリース（2025年7月、https://www.fra.go.jp/home/kenkyushokai/press/pr2025/20250708_press.html）
• 日本経済新聞「ウナギ完全養殖、民間参入で育て 人工ふ化で『かば焼き』26年夏食卓へ」（2026年1月、https://www.nikkei.com/article/DGXZQOUB150ER0V10C26A1000000/）
• IUCN Red List — Anguilla japonica（2014年EN指定）